NGHIÊN CỨU ỨNG DỤNG PHƯƠNG PHÁP NESTED PCR TRONG CHẨN ĐOÁN VIRUT GÂY HỘI CHỨNG ĐỐM TRẮNG Ở TÔM THẺ CHÂN TRẮNG (Litopenaeus vannamei) TẠI QUẢNG NINH
Tác giả: Trương Thị Mỹ Hạnh, Lê Thị Mây, Nguyễn Minh Quân, Phạm Thế Việt, Trương Thị Thành Vinh, Nguyễn Thị Hương Giang
Tạp chí Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn
Quyển: Trang: 153
Năm xuất bản: 10/2022
Tóm tắt
Vi rút gây hội chứng đốm trắng (WSSV) là một trong những tác nhân nguy hiểm gây bệnh trên tôm nuôi nước lợ, làm ảnh hưởng lớn đến nghề nuôi tôm công nghiệp trên toàn thế giới. Mặc dù bệnh được phát hiện từ năm 1992 nhưng đến nay vẫn là bệnh gây thiệt hại lớn cho người nuôi. Việc xác định sớm và chính xác sự có mặt tác nhân gây bệnh có ý nghĩa lớn trong việc dập dịch cũng như phòng bệnh cho tôm nuôi. Sử dụng mẫu mô tôm nhiễm vi rút đốm trắng (WSSV), tách chiết bằng 03 bộ kit tách chiết khác nhau và đánh giá chất lượng tách chiết của 03 phương pháp. Tối ưu quy trình PCR bằng cách thay đổi nhiệt độ bắt cặp mồi theo dải nhiệt độ xác định nhiệt độ bắt cặp mồi tối ưu. Lựa chọn quy trình PCR được tối ưu nhằm chẩn đoán bệnh WSSV trên tôm thu được tại Quảng Ninh. Kết quả nghiên cứu xác định phương pháp tách chiết theo bộ kit IQ2000-CTAB cho hiệu quả tốt nhất. Phương pháp cuẩn đoán Nested PCR sử dụng cặp mồi 146 với nhiệt độ bắt cặp mồi 60oC là tối ưu nhất, nồng độ DNA ≥ 0.3μg/ml. Xác định được 45/140 mẫu tôm nhiễm đốm trắng.
Từ khóa
chẩn đoán, tối ưu, WSSV