page loader
Frequent gene flow blurred taxonomic boundaries of sections in Lilium L. (Liliaceae)
Tác giả: Xun Gong, Kuo-Hsiang Hung, Yu-Wei Ting, Tsai-Wen Hsu, Lenka Malikova, Huyen-Trang Tran, Chao-Li Huang, Shih-Hui Liu, Tzen-Yuh Chiang
280    0
PLOSONE
Quyển:     Trang:
Năm xuất bản: 8/2017
Tóm tắt
Luồng gen giữa các loài có thể tồn tại lâu dài trong thực vật. Sự tái cấu trúc chắc chắn gây ra những khó khăn trong quá trình tái tạo phát sinh loài. Trong nghiên cứu này, chúng tôi đã xem xét sự phân kỳ di truyền và sự phát sinh loài của 20 loài Lilium dựa trên phân tích nhiều bộ ba của 8 gen của DNA lục lạp (cpDNA), bộ đệm DNA ribosome nhân được phiên mã bên trong (nrITS) và 20 locus được chiết xuất từ ​​thẻ trình tự biểu hiện ( EST) thư viện của L. longiflorum Thunb. và L. formosanum Wallace. Sự phát sinh loài dựa trên dữ liệu kết hợp của cpDNA và nrITS được thừa kế từ mẹ phần lớn phù hợp với phân loại của các phần Lilium. Phát sinh loài này được coi là cây loài giả thuyết và phát hiện ra ba nhóm, tức là, Cụm A bao gồm 4 đơn vị phân loại từ các phần Pseudolirium và Liriotypus, Cụm B bao gồm 4 đơn vị phân loại từ các phần Leucolirion, Archelirion và Daurolirion, và Cụm C bao gồm 10 đơn vị phân loại chủ yếu là từ các phần Martagon và Sinomartagon. Ngược lại, sự không nhất quán có hệ thống xảy ra trên các locus EST, có tới 19 gen (95%) hiển thị các cấu trúc liên kết cây khác với cây loài giả định. Sự không hợp nhất về phát sinh loài có thể là do sự trao đổi gen thường xuyên giữa các loài / bộ phận, được chỉ ra bởi mức độ tái tổ hợp gen cao và các phân tích IMa với locus EST. Tuy nhiên, phân tích đa bộ ba có thể cung cấp thông tin bổ sung giữa các locus về sự phân chia loài và mức độ dòng gen giữa các loài. Kết luận, nghiên cứu này không chỉ phát hiện dòng gen thường xuyên giữa các phần Lilium dẫn đến sự không tương đồng về phát sinh loài mà còn tái tạo lại một cây loài giả định giúp hiểu rõ hơn về bản chất của các mối quan hệ phức tạp giữa các loài Lilium.
Từ khóa
Gene flow, Lilium L.